為更好的幫助到想要利用神經(jīng)影像做科研的朋友們，拓展思影科技的業(yè)務(wù)范圍,思影推出嚙齒類動(dòng)物（大小鼠）數(shù)據(jù)處理業(yè)務(wù)，如感興趣請(qǐng)聯(lián)系楊曉飛siyingyxf或18983979082（微信號(hào)）進(jìn)行咨詢，電話：18580429226：
思影嚙齒類動(dòng)物（大鼠/小鼠）數(shù)據(jù)處理現(xiàn)主要涵蓋sMRI（T1加權(quán)像）、dMRI（DWI，彌散加權(quán)成像）和fMRI（功能磁共振）三種模態(tài)。
一、數(shù)據(jù)質(zhì)量控制
思影幫助客戶進(jìn)行數(shù)據(jù)質(zhì)量控制，包括數(shù)據(jù)預(yù)處理前的數(shù)據(jù)整理（模態(tài)信息整合、查漏）、掃描參數(shù)評(píng)估（包括序列的voxel size、TR、TE、時(shí)長(zhǎng)等指標(biāo)是否符合科研使用）和數(shù)據(jù)質(zhì)量的人工篩查（明顯的偽影篩除、掃描是否完整等）。
二、fMRI數(shù)據(jù)處理業(yè)務(wù)
1、fMRI數(shù)據(jù)預(yù)處理
數(shù)據(jù)預(yù)處理內(nèi)容包括：功能磁共振數(shù)據(jù)預(yù)處理流程包括數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換（dicom to nifti）、去除不穩(wěn)定時(shí)間點(diǎn)（remove timepoints）、時(shí)間層校正（slice timing）、頭動(dòng)校正（realign/head motion correction）、空間標(biāo)準(zhǔn)化（normalization）、空間平滑（smooth）、去線形漂移（detrend）、去尖峰（despiking）、濾波（filtering）、回歸協(xié)變量（nuisance covariates regression）、去除頭動(dòng)過(guò)大的時(shí)間點(diǎn)（scrubbing）等，思影工程師將根據(jù)數(shù)據(jù)處理方案、科研標(biāo)準(zhǔn)和客戶偏好靈活調(diào)整數(shù)據(jù)預(yù)處理參數(shù)，達(dá)到個(gè)性化數(shù)據(jù)處理需求。
圖例數(shù)據(jù)預(yù)處理流程
2、rs-fMRI指標(biāo)計(jì)算與組水平統(tǒng)計(jì)
1）頻域信號(hào)分析（ALFF、fALFF、slow3、slow4、slow5等）
通過(guò)傅立葉變換，計(jì)算血液動(dòng)力學(xué)相關(guān)的特定頻率段（如0.01～0.08Hz）的振幅信息，可以反應(yīng)大腦局部活動(dòng)強(qiáng)度。
2）局部一致性分析（ReHo）
通過(guò)計(jì)算一定數(shù)目相鄰體素在體素水平上的肯德爾和諧系數(shù)，可以反應(yīng)靜息時(shí)間段內(nèi)局部血氧水平的功能一致性。
3）連接分析（voxel-wise FC、ROI-wise FC、VMHC、動(dòng)態(tài)功能連接、格蘭杰因果等）
通過(guò)計(jì)算ROI與ROI、ROI與voxel之間時(shí)間序列的pearson相關(guān)系數(shù)，可以反映腦區(qū)間功能連接屬性；還可以在此基礎(chǔ)上計(jì)算左右腦鏡像位置的功能連接、通過(guò)加窗方式計(jì)算功能連通性在時(shí)間維度的動(dòng)態(tài)變化等；以及利用因果模型探索功能連接的方向性。
voxel-wise FC數(shù)據(jù)處理
ROI-wise FC數(shù)據(jù)處理
4）基于圖論的腦網(wǎng)絡(luò)分析
基于大尺度腦區(qū)間ROI-wise功能連接結(jié)合圖論理論可以進(jìn)一步進(jìn)行腦網(wǎng)絡(luò)的圖論屬性分析（小世界屬性、Rich-club系數(shù)、度中心性、模塊化等）。
圖論屬性分析流程
5）基于ICA的腦網(wǎng)絡(luò)分析方法
通過(guò)盲源分離算法，在組水平上計(jì)算出時(shí)間上相互獨(dú)立的體素集合，來(lái)找出具有功能一致性的大腦區(qū)域，以此界定不同的腦功能網(wǎng)絡(luò)，還可以進(jìn)一步對(duì)網(wǎng)絡(luò)內(nèi)（within network，即ICA spatial map統(tǒng)計(jì)）和網(wǎng)絡(luò)間（between network，即（dynamic）functional network connectivity，F(xiàn)NC/dFNC）的功能連接進(jìn)行組水平統(tǒng)計(jì)。
大鼠ICA成分圖例
3、任務(wù)態(tài)數(shù)據(jù)分析
通過(guò)刺激的時(shí)間序列構(gòu)建基于被試的設(shè)計(jì)矩陣并通過(guò)一般線性模型擬合全腦BOLD時(shí)間序列，計(jì)算出刺激對(duì)應(yīng)的全腦激活映射。
激活分析圖例
4、組水平統(tǒng)計(jì)與可視化
上述功能磁共振指標(biāo)均可進(jìn)行統(tǒng)計(jì)比較，包括t檢驗(yàn)、方差分析、回歸分析以及置換檢驗(yàn)等；本公司提供多樣化的多重比較校正方案如FWE校正、FDR校正、AlphaSim校正、GRF校正、TFCE校正以及NBS校正（只限于ROI-wise FC矩陣統(tǒng)計(jì)）等；同時(shí)還提供定制化結(jié)果可視化方案，可根據(jù)客戶提供的文獻(xiàn)圖例進(jìn)行可視化。
三、sMRI數(shù)據(jù)處理業(yè)務(wù)
1、基于體素的形態(tài)學(xué)分析（VBM）
借助FSL/VBM8等工具包對(duì)T1像進(jìn)行分割、配準(zhǔn)并計(jì)算灰白質(zhì)體積密度。
灰白質(zhì)分析圖例
2、結(jié)構(gòu)協(xié)變連接分析
根據(jù)已有圖譜提取分割好的灰質(zhì)體積值，構(gòu)建組水平結(jié)構(gòu)協(xié)變連接矩陣并進(jìn)行組間比較。
3、組水平統(tǒng)計(jì)與可視化
上述結(jié)構(gòu)磁共振指標(biāo)均可進(jìn)行統(tǒng)計(jì)比較，包括t檢驗(yàn)、方差分析、回歸分析以及置換檢驗(yàn)等；本公司提供多樣化的多重比較校正方案如FWE校正、FDR校正、AlphaSim校正、GRF校正、TFCE校正等等；同時(shí)還提供定制化結(jié)果可視化方案，可根據(jù)客戶提供的文獻(xiàn)圖例進(jìn)行可視化。
四、dMRI（彌散成像）數(shù)據(jù)處理業(yè)務(wù)
1、數(shù)據(jù)預(yù)處理
思影會(huì)對(duì)您采集的數(shù)據(jù)質(zhì)量進(jìn)行把關(guān)，數(shù)據(jù)預(yù)處理具體包括數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換、渦流校正、梯度方向矯正等。
2、張量構(gòu)建與指標(biāo)計(jì)算
思影根據(jù)不同的數(shù)據(jù)類型以及客戶的不同需求，可構(gòu)建多種彌散模型（如彌散張量DTI、彌散峰度成像DKI、神經(jīng)突強(qiáng)度和散度成像NODDI等等）并計(jì)算對(duì)應(yīng)的彌散指標(biāo)。
DTI和DKI指標(biāo)圖圖例
3、纖維追蹤
思影可根據(jù)不同的數(shù)據(jù)類型以及客戶的不同需求，可采取多種彌散模型（如彌散張量模型DTI、約束球形反卷積CSD、彌散譜成像DSI等等）
基于不同模型的確定性纖維追蹤
基于不同模型的概率性纖維追蹤
4、圖論分析
基于腦區(qū)間纖維追蹤結(jié)合圖論理論可以進(jìn)一步進(jìn)行腦網(wǎng)絡(luò)的圖論屬性分析（小世界屬性、Rich-club系數(shù)、度中心性、模塊化等）。
五、腦影像機(jī)器學(xué)習(xí)
1、基于體素的MVPA
MVPA即通過(guò)fMRI、sMRI以及dMRI的參數(shù)映射（ALFF、ReHo、FC；GM；FA、MD、RD等腦圖）可對(duì)臨床/行為學(xué)指標(biāo)進(jìn)行分類和回歸預(yù)測(cè)。思影提供的分類/回歸機(jī)器學(xué)習(xí)模型包括SVM、SVR、RVR、LASSO、ElasticNet等。
2、基于腦連接組的機(jī)器學(xué)習(xí)
基于上述fMRI功能連接和纖維追蹤構(gòu)建的結(jié)構(gòu)連接，可對(duì)臨床/行為學(xué)指標(biāo)進(jìn)行分類和回歸預(yù)測(cè)。本公司提供的分類/回歸機(jī)器學(xué)習(xí)模型包括CPM、SVM、SVR、RVR、LASSO、ElasticNet等。
六、注釋：
客戶與思影確定合作意向以后，思影會(huì)指定專門的工程師全程與客戶對(duì)接項(xiàng)目著手該項(xiàng)目數(shù)據(jù)處理，思影額外還將指派另一名工程師對(duì)項(xiàng)目全程進(jìn)行檢查，審核，把關(guān)，確保數(shù)據(jù)處理質(zhì)量，思影將全程對(duì)客戶數(shù)據(jù)保密。
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如對(duì)思影課程感興趣也可微信號(hào)siyingyxf或18983979082咨詢。覺(jué)得有幫助，給個(gè)轉(zhuǎn)發(fā)，或許身邊的朋友正需要。請(qǐng)直接點(diǎn)擊下文文字即可瀏覽思影科技其他課程及數(shù)據(jù)處理服務(wù)，歡迎報(bào)名與咨詢，目前全部課程均開放報(bào)名，報(bào)名后我們會(huì)第一時(shí)間聯(lián)系，并保留名額。
更新通知：第十屆腦影像機(jī)器學(xué)習(xí)班（已確定）
更新通知：第十二屆磁共振彌散張量成像數(shù)據(jù)處理班（已確定）
第六屆任務(wù)態(tài)fMRI專題班（預(yù)報(bào)名，南京）
更新通知：第二十八屆磁共振腦影像基礎(chǔ)班（重慶，已確定）
第七屆磁共振ASL（動(dòng)脈自旋標(biāo)記）數(shù)據(jù)處理班（預(yù)報(bào)名）
磁共振腦影像結(jié)構(gòu)班(預(yù)報(bào)名)
彌散磁共振成像數(shù)據(jù)處理提高班（預(yù)報(bào)名)
小動(dòng)物磁共振腦影像數(shù)據(jù)處理班（預(yù)報(bào)名）
腦電信號(hào)數(shù)據(jù)處理提高班（預(yù)報(bào)名）
眼動(dòng)數(shù)據(jù)處理班（預(yù)報(bào)名）
近紅外腦功能數(shù)據(jù)處理班（預(yù)報(bào)名）
數(shù)據(jù)處理業(yè)務(wù)介紹：
招聘及產(chǎn)品：
招聘：腦影像數(shù)據(jù)處理工程師（重慶&南京）