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思影科技影像組學(xué)(Radiomics)數(shù)據(jù)處理業(yè)務(wù)

2023-01-16

      醫(yī)學(xué)影像(Radiology+組學(xué)(Omics)構(gòu)成影像組學(xué)(Radiomics),其強(qiáng)調(diào)的深層次含義是指從影像(CTMRI、PET等)中高通量地提取大量影像信息,實(shí)現(xiàn)腫瘤分割、特征提取與模型建立,憑借對(duì)海量影像數(shù)據(jù)信息進(jìn)行更深層次的挖掘、預(yù)測(cè)和分析來輔助醫(yī)師做出最準(zhǔn)確的診斷。近年來,影像組學(xué)已成臨床科研熱點(diǎn)之一,針對(duì)于此,思影科技推出影像組學(xué)(Radiomics)數(shù)據(jù)處理業(yè)務(wù)。如感興趣請(qǐng)聯(lián)系楊曉飛siyingyxf18983979082(微信號(hào))進(jìn)行咨詢,電話:18580429226

一、數(shù)據(jù)預(yù)處理

      數(shù)據(jù)質(zhì)量檢查:檢查圖像形變、缺損、偽影;檢查圖像參數(shù)等。

      數(shù)據(jù)預(yù)處理:體素重采樣,體素強(qiáng)度離散化,圖像歸一化,圖像灰度值標(biāo)準(zhǔn)化處理等。


二、圖像分割

      手工繪制或者利用卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN,U-NET等神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)自動(dòng)分割ROI/VOI 區(qū)域,確定腫瘤所在位置。

圖示:多模態(tài)MRI膠質(zhì)瘤亞區(qū)分割視圖

三、特征提取

1、特征提取

1)語義特征:位置、尺寸等

2)非語義特征:形狀特征、描述各體素信號(hào)強(qiáng)度值分布情況的一階特征、描述各體素之間關(guān)系的二階特征(如:紋理特征)以及濾波獲取的高階特征。

2、特征選擇

1)相關(guān)法。計(jì)算每個(gè)特征與量表的相關(guān)性(如皮爾遜相關(guān)),保留相關(guān)值高的特征。   

2)參數(shù)檢驗(yàn)法。對(duì)不同組別人群的特征做假設(shè)檢驗(yàn)(比如對(duì)兩組人群的特征做雙樣本T檢驗(yàn)),保留通過假設(shè)檢驗(yàn)的特征。   

3)主成分分析(PCA)法。將所有特征分解成一系列主成分,保留排名靠前的主成分作為特征。   

4)遞歸特征消除法。循序漸進(jìn)地刪除影響最小的特征,直至保留特定數(shù)目的最重要的特征為止。    

5)稀疏特征表示??梢赃x擇使用LASSO回歸(及其變種)、低秩(Low-Rank)等特征選擇/表示方法。

四、機(jī)器學(xué)習(xí)建模

1.有監(jiān)督學(xué)習(xí)模型:邏輯回歸(logistic)、支持向量機(jī)(SVM)、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、樸素貝葉斯(NB)、決策樹(DT)以及基于決策樹基礎(chǔ)的集成樹算法(RF、GBDTXGboost)等。

2.無監(jiān)督學(xué)習(xí)模型:K-means聚類,密度聚類,層次聚類等

五、深度學(xué)習(xí)建模1、判別式深度學(xué)習(xí)算法:卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)、堆疊自動(dòng)編碼器、多層感知器等。2生成式深度學(xué)習(xí)算法:生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)(GAN)、變分自動(dòng)編碼器、深度強(qiáng)化學(xué)習(xí)(RL)和深度信念網(wǎng)絡(luò)(DBN)等。 

六、結(jié)果匯報(bào)&可視化1.結(jié)果匯報(bào)
1)對(duì)于分類模型,匯報(bào)準(zhǔn)確率(Accuracy)、敏感性(Sensitivity)、特異性(Specificity)、ROC曲線下面積(AUC)等精度指標(biāo);
2)對(duì)于回歸模型,可以匯報(bào)相關(guān)值、MSE、MAE等精度指標(biāo);
3)置換檢驗(yàn)的結(jié)果,如p值。
2.
可視化
1)對(duì)于分類模型,可繪制ROC曲線圖;   
2)對(duì)于回歸模型,可繪制相關(guān)圖;   
3)對(duì)于模型訓(xùn)練過程中發(fā)現(xiàn)的貢獻(xiàn)較大的特征,可繪制點(diǎn)線圖、矩陣圖、圈狀圖等等。

七、定制化分析       
閱讀了一篇經(jīng)典論文,是否期望把先進(jìn)的方法組合應(yīng)用在自己的研究?思影科技可以為您提供定制化分析服務(wù)。     
1)分析方法可定制。思影科技可根據(jù)您提供的模板文獻(xiàn),基于您的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),實(shí)現(xiàn)文獻(xiàn)中使用的數(shù)據(jù)分析方法。此外,未列出的分析方法,只要在思影科技的能力范圍內(nèi),盡力實(shí)現(xiàn)您的想法。    
2)分析代碼可定制。在沒有現(xiàn)有的軟件適用于您的數(shù)據(jù)分析需求時(shí),思影科技會(huì)與您協(xié)商,通過編寫代碼實(shí)現(xiàn)您的想法,并提供代碼的完整實(shí)現(xiàn)。
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數(shù)據(jù)分析課程:重慶:
第二十三屆磁共振腦影像結(jié)構(gòu)班(重慶,2.8-13
第七十三屆磁共振腦影像基礎(chǔ)班(重慶,2.17-22
第二十五屆腦影像機(jī)器學(xué)習(xí)班(重慶,2.26-3.3
南京:
第三十五屆磁共振腦網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)處理班(南京,2.1-6
第二十六屆腦影像機(jī)器學(xué)習(xí)班(南京,2.17-22
北京:
第三十四屆磁共振腦網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)處理班(北京,2.9-14
第七十五屆磁共振腦影像基礎(chǔ)班(北京,2.23-28
上海:
第二十五屆磁共振腦影像結(jié)構(gòu)班(上海,2.3-8
第二十九屆擴(kuò)散成像數(shù)據(jù)處理班(上海,2.11-16
第十四屆任務(wù)態(tài)功能磁共振數(shù)據(jù)處理班(上海,2.22-27

第七十七屆磁共振腦影像基礎(chǔ)班(上海,3.3-8
腦電及紅外、眼動(dòng):北京:
第五屆R語言統(tǒng)計(jì)班(北京,2.1-5
第三十屆腦電數(shù)據(jù)處理入門班(北京,2.16-21
南京:

第二十九屆腦電數(shù)據(jù)處理入門班(南京,2.26-3.3
招聘及產(chǎn)品:
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